Autocigosis y diversidad genómica en la raza porcina en riesgo Gochu Asturcelta: contribuciones para programas de conservación ganadero

Descripción del proyecto

El Gochu Asturcelta es una raza porcina en riesgo extremo. La viabilidad de la población depende de un estricto programa de apareamientos que persigue mantener su variabilidad genética y, por tanto, su capacidad de adaptación a futuros requerimientos de los criadores y el mercado “slow food”. En colaboración con la Asociación de Criadores de Gochu Asturcelta (ACGA) se ha obtenido un denso pedigrí, que cuenta con individuos con genealogías formadas por generaciones discretas y solapadas, y que ha sido genotipado con paneles de SNPs de alta densidad (Axiom porcine 660K array) de Affymetrix que consta de 658692 SNPs. El objetivo del proyecto es la estimación, mediante observación directa del genoma, de fenómenos genéticos de importancia para asegurar la viabilidad de las poblaciones ganaderas en riesgo como la recombinación, purga de alelos deletéreos, el barrido genómico. Para ello se han seleccionado 492 animales que forman un total de 478 tríos (padre-madre-hijo) descendientes de 61 familias (misma pareja de padre y madre) que se han genotipado con 545364 SNPs útiles en los 18 cromosomas porcinos.

El proyecto Autogenome ha sido promovido por ACGA, que considera que la realización de actividades de investigación sobre poblaciones locales amenazadas, en este caso la raza porcina Gochu Asturcelta, es de gran importancia para el aprecio social de recursos genéticos de tan destacada importancia histórica y social. El Gochu Asturcelta es un laboratorio vivo que puede permitir estudiar parámetros de importancia en conservación de la diversidad y su relación con el genoma, como la relación entre la consanguinidad creada por el apareamiento entre parientes y la capacidad evolutiva de las poblaciones o el efecto de la selección en la purga de alelos deletéreos causantes de depresión consanguínea en caracteres productivos y reproductivos. Katherine Arias ha recibido financiación de la Agencia Estatal de Investigación y Fondo Social Europeo dentro del programa para Formación de Personal Investigador (FPI) mediante la ayuda PRE2020-092905.
 

Socios

Asociación de Criadores de Gochu Asturcelta (ACGA)

Organismos financiadores

Ministerio de Ciencia e Innovación, Agencia Estatal de Investigación